Multiple Sequence Alignment

释义 Definition

多序列比对：一种生物信息学方法，用来把三条或以上的 DNA、RNA 或蛋白质序列按相似性进行对齐，以识别保守区域、推断同源关系，并辅助构建系统发育树或进行功能/结构预测。（也常简写为 MSA）

发音 Pronunciation (IPA)

/ˈmʌltɪpəl ˈsiːkwəns əˈlaɪnmənt/

例句 Examples

We used multiple sequence alignment to compare the protein sequences.
我们使用多序列比对来比较这些蛋白质序列。

After performing multiple sequence alignment, the conserved motifs suggested the genes share a common ancestor, supporting the phylogenetic analysis.
完成多序列比对后，保守基序提示这些基因具有共同祖先，从而支持了系统发育分析。

词源 Etymology

该术语由三部分组成：multiple（多个）+ sequence（序列）+ alignment（对齐/比对）。其中 alignment 原意是“排成一线、对齐”，在计算与生物信息学语境中引申为把序列按规则插入空位（gap）以实现“最合理的对应关系”。随着 20 世纪后期分子生物学与计算方法的发展，“多序列比对”成为比较基因/蛋白家族与研究进化关系的核心概念之一。

相关词 Related Words

• Alignment
• Sequence
• Homology
• Conserved
• Motif
• Phylogeny
• Gap
• BLAST
• Clustal
• MUSCLE

文学与著作中的用例 Notable Works

• Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids（Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison）
• Bioinformatics and Functional Genomics（Jonathan Pevsner）
• “MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput”（Edgar, 2004）
• “Clustal W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment…”（Thompson, Higgins, Gibson, 1994）
• Fundamentals of Molecular Evolution（Dan Graur 等）